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林木育种国家工程实验室以林木遗传育种国家重点学科、植物学国家重点学科和生化与分子生物学博士点学科为主要支撑学科,下设树木分子遗传与功能基因组、林木分子标记辅助育种、林木基因工程育种、林木细胞遗传与细胞工程育种、林木良种繁育等专门实验室,及与之配套的人工气候室、温室、组培室和大型仪器设备室等。实验室和温室总面积约3000余平方米,共有仪器设备700余台/套。